困难多肽的合成(原因以及解决方案)

1 “困难序列”形成的主要原因

根据形成原因的不同,多肽“困难序列”可以分为随机和非随机两种类型[5],随机型“困难序列”与氨基酸疏水性及立体位阻有关。当氨基酸的

立体位阻较大(如氨基酸的侧链具有较大保护基)时,酰化试剂扩散困难;或树脂的负载量较大时,树脂上的肽链溶剂化不完全,偶联结果都很差

[5]。随机困难肽可以通过疏水性参数来粗略表示[6],现在仍没有一条“黄金规则”能准确预测。一般认为,当疏水性参数达到正数,其合成

就相当困难[7]。非随机型“困难序列”是指易形成具有稳定且特异性 β-折叠结构的肽链序列。该类序列的肽链在一定长度时很容易发生氢键缔

合,且与树脂载体之间也容易出现分子聚集现象,多肽分子的氨基可能埋没在二级结构的深处,进而阻止缩合反应,此现象常出现在难溶多肽的合

成中[4,8]。使用 9-芴甲氧羰基(Fmoc)保护的氨基酸合成多肽时容易形成这种 β-折叠结构,合成过程需要改变反应条件如提高温度等破坏这

种构型,但这可能会导致产物消旋化或提前脱除Fmoc保护等不良反应[7]。 2 解决“困难序列”多肽合成困难的方法解决“困难序列”多肽合成

困难的方法有很多,可以从改变反应体系、改变反应条件、改变合成策略、采用新的合成技术手段等方面进行。 2. 1 改变反应体系2. 1. 1 使用

混合溶剂 多肽树脂在溶剂中达到充分溶胀状态时,有利于缩合反应的进行。当选用如N- 甲 基 吡 咯 烷 酮(NMP)、N,N- 二 甲 基 甲 酰 胺(

DMF)、二 甲 亚 砜(DMSO)、N,N-二 甲 基 乙 酰 胺(DMAc)等受氢溶剂时,其羰基(C=O)与肽链上的N-H 可以形成氢键,从而抑制了肽链自

身形成氢键而造成的聚集,进而抑制 β-折叠的生成。因此,选用 合 适 的 混 合 溶 剂 ,比 如 DMSO/DMF、6N 胍 啶/DMF、异丙醇/DMF、二氯

甲烷(DCM)/DMF/NMP、三氟乙醇(TFE)等有助于缩合反应的进行。黄惟德在《多肽合成》一书中提到,DMF为溶剂的反应液中加入 20%体积的三

氟乙醇(TFE)可帮助接肽速率提高[9]。朱亮亮等在大位阻氨基酸Fmoc-Arg(Pbf)-OH与Rink Amide-AM树脂的高效缩合中以DMAc/DCM为反应溶剂

,连接率高达93%[10]。 2. 1. 2 使用溶胀性能更好的树脂 当树脂的负载量较大时,树脂上的肽链溶剂化不完全,偶联结果很差[5]。使用溶

胀性较好的树脂,同时减少树脂担载量,有利于“困难序列”多肽的合成。比如Winkler等 在 合 成“ 困 难 序 列 ”多 肽 K5( 序 列 :

CGGKVSALKEKVSALKEKVSALKEKVSALKEKVSALKE)时,采用 PEG-PS 树脂代替常规的 PS/DVB 树 脂,使得粗肽收率有了显著性提高[11]。然而,由于

成本高昂,这种方法不适合于大规模的工业生产[12-13]。 2. 1. 3 选用高效缩合试剂 选用高效缩合试剂,可以有效地促进缩合反应的顺利进行

,也是解决“困难序列”多肽合成困难的一种常见方案,见图1。通常DIC的反应活性低于HBTU,HBTU的反应活性低于TBTU、PyBOP和HATU[14-15]

。所以,在反应活性比较低的时候,可以选择高活性的缩合试剂。

2. 2 改变反应条件

2. 2. 1 提高反应温度 提高反应温度有助于降低链聚合现象。BACSA B等[16]在合成1个九肽的实验中发现将合成温度提高到 60 ℃左右,最终产

品的纯度可达到 83%。然而,提高反应温度会导致新的不良反应的发生,比如侧链保护基的断裂[17]。所 以,在尽可能减少不良反应的情况下,

可以提高反应的温度。 2. 2. 2 调节反应 pH 值 调节反应 pH 值能改变多肽在溶剂中的溶解度,从而提高“困难序列”多肽的合成效率。比如

QIN X 等[18]、AJIKUMAR P K 等[19]研究了体系的 pH 值对多肽收率的影响,发现根据多肽序列中酸性和碱性氨基酸的数量,适当调节溶剂的

pH值,可以提高肽链的溶解性,促进反应的进行。然而,由于在该 pH值条件下,多肽保护基可能不稳定,所以不常使用[20]。 2. 2. 3 使用高

离液盐 高离液盐能破坏肽链间的氢键,从而破坏 β-折叠结构,提高“困难序列”多肽的合成效率。常见的高离液盐有尿素、LiCl、NaClO4 等。

比如,WESTALL F C等[21]在合成“困难序列”多肽时,发现加入尿素之后可使 Asn 及 Glu 的缩合率由70%提高至100%。这可能是由于尿素具

有受氢能力,干扰了肽链上的氢键缔合,从而促进了多肽的合成。然而,使用高离液盐会降低反应液的浓度,对反应速率有一定影响。2. 3 改变合

成策略

2. 3. 1 片断合成法 常规多肽固相合成,是从碳端开始按照氨基酸的顺序依次合成。当遇到“困难序列”时,采用片段合成法先制备带有保护基的

中间序列片段,再经过进一步活化、缩合得到保护的多肽,最后脱去保护基得到目标多肽。片段合成要考虑多肽片段的长短、连接位点和固相载体

这 3 个关键因素。由于肽段羧基端氨基酸比氨基端氨基酸更容易发生消旋反应,因此首先选择多肽片段 C末端的氨基酸。适合做C末端的氨基酸有

Gly(甘氨酸)、Pro(脯氨酸)、Glu(谷氨酸)、Leu(亮氨酸)和Asn(天冬酰胺)等[22]。周建华等[23]以王树脂为固相载体制得 25-34

肽树脂;以 2-氯三苯甲基氯树脂为固相载体制得 1-11、12-16 和 17-24 等 3 个片段的全保护肽;然后将 3 个片段的全保护肽按照肽序依次缩合

到 25-34 的肽树脂上,经三氟乙酸切割并脱除侧链保护基得特立帕肽粗品。SHI L等[24]采用片段合成法顺利地合成了阮病毒蛋白片段。张颖等

[25]在合成含有 3 股 β 折叠的齐考诺肽(25 肽,序列:CKGKG AKCSR LMYDC CTGSC RSGKC-NH2)的过程中,采用固相合成得到4个片段,分别

是[19-25]A、 [12-18]B、[6-11]C 和[1-5]D,再将 B、C、D 依次偶联到肽树脂A上,最后从树脂上裂解得到线形粗肽。该方法相对于传统

的逐步缩合方法,缩短了合成周期,提高了粗肽的收率和纯度,为长肽的合成难题提供了可行性的解决方案。 2. 3. 2 引入化学修饰的肽链 引入

化学修饰的肽链,将“困难序列”多肽的高级结构暂时性破坏,促进肽的溶解,从而有利于多肽的合成。比如,当肽链中含有脯氨酸片段时,缩合

形成的酰胺键没有可以形成氢键的质子,脯氨酸的 α 碳原子处在五元环的刚性结构中,从而抑制了 β-折叠结构的形成,所 以,在合成“困难序

列”时可以考虑引入脯氨酸来减少合成的难度。WHITE P 等[26]在合成一些较长多肽序列(95肽)的时候引入伪脯氨酸二肽结构(类似脯氨酸结

构)保护氨基酸来改善聚集问题,见图 2。Ser、Thr和Cys 3个氨基酸可以和序列中邻近的氨基酸形成一个伪脯氨酸二肽(fPro),肽链在树脂上组

装完成后,放在 TFA 溶液中搅拌,将多肽从树脂上裂解下来,同时恢复正常的序列,不会影响多肽的性质[27-28]。经典的“困难序列”多肽合

成策略

3. 1 胸腺法新的合成 胸腺法新(胸腺肽 α1)的 序 列 为 Ac-SDAAV-DTSSE-ITTKD-LKEKK-EVVEEAEN-OH,是一个 28 肽。主要用来治疗慢性乙型

肝炎,具有良好的免疫调节作用[36]。胸腺法新的酸性残留位置、疏水性氨基酸的连续存在(Thr-Thr、Val-Val)

和需要大量的保护基(20 个侧链保护基)等造成了其固相合成的困难。采用Fmoc策略合成时,C端第1 个氨基酸会用到 Fmoc-Asn(Trt)-OH,立体

位阻很大。连续疏水性缬氨酸(Val-Val)的出现,会造成β-折叠的生成;已有大量的实验证明,偶联至第9个氨基酸(K)时,多肽的纯度会急剧

下降,胸腺法新是一个典型的“困难序列”多肽(图4)。自胸腺法新被发现以来,多位研究者采用不同

的策略致力于该“困难序列”的合成。最早来自于1980 年美国罗氏公司和美国洛克菲勒大学的研究者,他们对主链氨基采用Boc保护的固相合成法

,总收率不到 7%[37],后经 WANG T W 等的改进(采用羟甲基-苯乙酰胺甲基树脂,增强了肽-树脂键的稳定性),纯化收率提高到 34%。然而,

采用 Boc 保护基的固相合成法,要频繁用到 TFA 和 HF 等腐蚀性气体,污染大,肽树脂不稳定,如今已很少被采用。漳州未名博欣生物医药有限公司-客户肽,多肽定制,多肽合成

为了提高胸腺法新的产率,1985年罗氏公司的FELIX A M 等[39]

尝试了片段合成法,然而,最后 4

步的收率仅为 30%。1988 年德国图宾根大学的ECHNER H等[40]

报道了用高效偶联试剂Bop做活化剂,氨基采用 Fmoc 保护,侧链采用 t-Bu 或 Boc 保护

的固相合成法,粗品收率达到 76%。但经过纯化后,纯品收率比较低。

在这些解决方案中,最成功的莫过于刘标等,他们以 HBTU/HOBt/DIPEA 体系作为缩合试剂,在易形α螺旋和β转角的肽序位置,通过采用HOBt/DIC

补投的方法促使偶联反应完全。以茚三酮显色的 法 对 反 应 进 行 监 控 ,获 得 的 粗 肽 纯 度 为67. 2%。以反相液相色谱法为主要分离手

段,通过多步离实现纯化。胸腺法新产品纯度达 99. 5%以上,总收率为 17. 2%[41]。另一个成功的解决方案是209年西班牙生物医学研究所和瑞

士Lonza公司合作提出的,他们采用改进的Fmoc/t-Bu的固相合成法,端的 Asp主链羧基用 t-Bu保护,侧链羧基连接到 PEG 氨基树脂上,即采用

Fmoc-Asp-OtBu 作为第一个入的保护氨基酸。该方法的粗品纯度达到90%[42]。 3. 2 扶素康的合成 扶素康是根据 HIV 膜蛋白gp4的结构设计的

新一代膜融合抑制剂,是一个36肽 ,其 序 列 为 :SWETW-EKEIE-NYTKQ-IYKILEESQE-QQDKN-EKDLL-E[4]。然而,由于肽链中含有大量的疏水性

氨基酸(W、T、I、L)和立体位阻很大的氨基酸(W、Q、N),以及需要大量的保护基(30 个侧链保护基)等造成了其固相合成的困难。扶素康的

早期合成采用固相逐步化学合成法。采用 Fmoc保护策略、王树脂为固相载体、反应溶剂为 DMF、HBTU/HOBt/DIPEA 为缩合剂,保护氨基酸 2倍过量

进行缩合反应、TFA/苯酚/EDT/水为切割条件,得到的粗肽纯度和收率都很低[44]。为了提高扶素康的产率,郭一琼等[44]采用片段合成的策略

。他们以 2-氯三苯甲基树脂和王树脂为固相载体,HBTU/HOBt/DIPEA 为缩合剂,DMF 为反应溶剂,用 HOAc(乙酸)/TFE/DCM 将全保护多肽片段由

树脂上切割下来。将全保护多肽片段依次偶联,再用 TFA溶液除去保护基。该条件下合成的扶素康粗品收率达 67. 31%,按标准曲线定量分析粗品

纯度为38. 75%[44]。

分享来源:赣 南 医 学 院 学 报

合肥科生景肽生物科技有限公司成立于2018年,目前已经打造了全球领先的以肽为核心的生命分子发现、合成生产、结构优化、递送平台,主要瞄准肽发现及靶向递送,专注于为各大制药企业、生物技术公司、科研单位提供一站式的定制化研发服务。 公司独有的KPDS™平台(KS-V Peptide Discovery Services Platform)是国际领先的的多肽药物发现平台,我们致力于创新药物的高效和精准开发,以科生景肽专有KPDS技术为核心,提供一站式,定制化的多肽发现服务,以灵活的产品形式和服务模式助力广大客户各类药物发现项目的快速推进和应用探究,包括但并不限于疾病诊断及保健功能产品、多肽药物、核素偶联药物(RDC)、基于小分子的肽药物偶联物(PDC)和多功能肽偶联物等。
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