2023年11月21日，清华大学曾坚阳教授（西湖大学教授）、赵诞老师团队，在Nature Communications上发表文章A knowledge-guided pre-training framework for improving molecular representation learning。作者提出了知识引导的预训练图Transformer (Knowledge-guided Pre-training of Graph Transformer，KPGT)，这是一个自监督学习框架，可以学习可泛化和鲁棒的分子表示。KPGT框架集成了专门为分子图设计的图Transformer和知识引导的预训练策略，以充分捕获分子的结构和语义知识。通过计算测试，KPGT在预测分子性质方面表现出卓越的性能，在药物发现中具有实际适用性。总的来说，KPGT可以为推进人工智能辅助药物发现过程提供强大而有用的工具。
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